宏基因组学（Metagenomics）是将环境样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科。宏基因组测序针对特定环境中全部微生物群落的基因组测序，能够全面了解微生物群落的分类和功能，且定量分析基因，进行基因功能注释和物种多样性分析。宏基因组测序能够对多个样品进行物种水平上和基因水平上的比较分析，找出有显著差异的物种和基因家族且进行聚类分析，一定程度上反应微生物的真实生存状态。
技术优势
● 测序覆盖度广：对特定环境中全部微生物群落的基因组进行测序
● 测序覆盖度高：单个测序不少于30M的reads数，产生至少5G可用数据
● 研究无偏性：宏基因组测序既能发现高丰度的物种，也能够发现低丰度的物种
● 研究功能强：不仅能够获得环境物种组成和丰度信息，还能够进行功能基因分型，比较样品间基因差异，研究物种间代谢网络
